Atemorgane fehlen bei manchen, vor allem kleinen Formen, bei denen die ganze Körperoberfläche im Dienst der Respiration steht; meist aber sind Kiemen entwickelt: äußere Anhänge der Extremitäten oder Körperseiten, die eine große Oberfläche, sehr zarte Cuticula und reiche Durchblutung aufweisen. Nicht selten funktioniert daneben, oder auch allein, die Carapaxinnenfläche als Atemorgan. Manche Krebse haben sich dem Leben auf dem Land angepasst und nehmen den Sauerstoff aus der Luft auf.